Il leggendario ladro gentiluomo Lupin III, insieme alla sua banda - lo scaltro pistolaio Daisuke Jigen, il samurai Goemon Ishikawa XIII e l'inafferrabile ladra Fujiko Mine - parte alla ricerca di un tesoro leggendario, nascosto su un'isola sperduta e non segnata su alcuna mappa.

All'arrivo, però, scoprono che l'atollo non è un semplice e inospitale relitto: gli abitanti dell'isola - inquietanti e ostili - rivelano che lì si nasconde qualcosa di molto più oscuro. Mentre il gruppo comprende di essere finito in una trappola, emerge la vera minaccia: un essere immortale, Muomu, intenzionato a distruggere l'umanità.

Quella che doveva essere una semplice caccia al tesoro si trasforma in una corsa contro il tempo: Lupin e compagni hanno appena 24 ore per sopravvivere, fermare Muomu e fuggire dall'isola prima che tutto vada perduto.

Fra inseguimenti, colpi di scena e scontri per la sopravvivenza, la missione diventa una disperata lotta per la vita, che metterà alla prova astuzia, coraggio e lealtà: la posta in gioco non è più un tesoro, ma la salvezza di tutti.